차선세는 차선 등록지나 차선세 압류의무인이 있는 세무서에서 납부해야 한다. 차량이 등록할 필요가 없는 경우 차량 소유자나 관리인이 있는 세무서가 납부해야 하므로 당사자가 등록해야 하는지 여부에 따라 달라진다.