객관적으로 말하자면, 현재의 엑시머 레이저 수술의 안전성은 비교적 높다. 가장 초기의 다이아 칼인 방사형 각막 절개술로 근시안을 치료하는 것에 비해 안전성이 질적인 비약이 있었다. 10 년 이상의 대량의 임상 관행이 이를 충분히 증명했다. 레이저 수술로 근시안을 치료하는 것은 국내에서 이미 비교적 성숙했다고 할 수 있다. 하지만 어떤 수술의 성공률도 100% 가 될 수 없다. 콘택트렌즈가 감염되기 쉽고 시력에 해로울 수 있는 것처럼, 안경렌즈가 깨지는 외상도 실명의 원인 중 하나다. 문장 안과지' 에 따르면 이런 안과수술의 실패율은110 으로 국내 대부분의 굴광수술 전문가들이 의견이 다르다. 물론, 좋은 수술 장비, 조작자의 숙련된 조작과 풍부한 경험, 그리고 환자의 좋은 조화는 수술의 높은 안전의 기초이다.
어떤 수술도 위험이 있고 근시 레이저 수술도 합병증을 완전히 피할 수 없다. 가장 흔히 볼 수 있는 합병증은 과교정이나 불충분한 교정이며, 일정한 시간을 관찰하고 상황에 따라 재수술을 해야 한다. 어떤 사람들은 눈부심, 즉 야간에 광점을 클러스터나 글로우로 간주하고, 수술 후 각막 조직간에 경미한 수종 반응이나 야간 동공이 커서 가장자리가 수술 가장자리에 가까워져 점차 줄어든다. 원추 각막은 이런 잠재력을 가지고 있거나 수술 후 각막이 너무 얇은 사람들에게 나타난다. 목표물에 대한 시선이 좋지 않아 편심절단이 발생하거나 각막 표면의 수증기 소용돌이의 작용으로 중앙섬이 나타날 수 있다. PRK 와 LASEK 수술 후 항하제 약물의 장기간 사용으로 각막 Haze 와 호르몬성 높은 안압이 나타날 수 있다. LASIK 에는 각막 판막 관련 합병증 (예: 판막 아래 이물질, 각막 판막 변위 용해, 난시 증가, 안구 건조증 등) 이 있다. 가장 심각한 것은 수술 중 각막 상처의 감염이다. 거의 발생하지 않지만 실명의 직접적인 원인이기 때문에 엄격한 수술 소독 제도와 환자의 좋은 위생 습관이 중요하다. 수술 후 정기적으로 눈을 검사해야 하며, 황반구와 주변 망막의 변화에 각별히 주의를 기울여 미리 대비할 수 있도록 해야 한다.