종합보세구역은 보세항과 마찬가지로 중국의 개방 수준이 가장 높고, 정책이 가장 우대하며, 기능이 가장 완벽하며, 절차가 가장 간단한 특수개방 지역이다. 보세구역보다 기능이 더 완비되어 있다. 기존 보세 구역, 보세 물류단지, 수출가공구 등 외향형 기능구역을 통합한 뒤 더욱 개방적인 형태로 국제관례에 부합한다.
종합보세구역은 내륙 지역에 설립된 보세항구 기능을 갖춘 세관 특수감독 지역이다. 세관은 관련 규정을 참고하여 종합 보세구 세금 및 외환 정책을 시행하고 보세구, 수출가공구, 보세물류구, 항구기능을 하나로 모아 국제 중계, 분담, 조달, 재수출 무역 및 수출가공을 발전시킬 수 있다.
현행 관련 정책에 따르면 세관은 보세구역에 대한 폐쇄관리를 실시하고, 외국 화물은 보세구역에 진입하여 보세관리를 실시한다. 중국의 다른 지역에서 보세구역에 들어가는 화물은 이미 출국한 것으로 간주된다. 동시에, 대외무역과 외환관리부문도 보세구역에 대해 상대적으로 우대하는 정책을 실시한다. 기업은 종합 보세구역에서 항구 업무를 전개한다. 화물은 공원 세관, 상품 검사 등의 부서를 거쳐 합격한 후, 모든 항구 (항구 또는 공항) 에서 수출할 수 있으며, 포장을 풀고 검사할 필요가 없다.