염소, 오존, 과산화수소와 같은 특정 소독제를 첨가하면 배출 전에 밸러스트 수를 비활성화할 수 있습니다. 소독제는 일정 농도 하에서 세균과 바이러스를 효과적으로 죽일 수 있다.
해양 환경과 생태계를 보호하기 위해 선박은 유해 물질과 생물이 환경에 미치는 피해를 줄이기 위해 밸러스트를 배출할 때 불활 화 처리를 해야 한다. 동시에, 더 심각한 환경오염을 피하기 위해 관련 법률과 기준에 따라 정기적으로 배출해야 한다.